Το Ιόνιον Ενυδρείο-Μουσείο της νήσου Κεφαλληνίας στοχεύει:
(ι) να φέρει σε επαφή τους μαθητές, την τοπική κοινωνία και γενικότερα τον κόσμο που επισκέπτεται τη νήσο με τους υποθαλάσσιους φυσικούς και πολιτιστικούς πόρους που βρίσκονται γύρω από την Κεφαλληνία,
(ιι) να αποτελέσει κέντρο παροχής γνώσεων στους μαθητές όλων των βαθμίδων για τον τρόπο λειτουργίας του θαλασσίου οικοσυστήματος και να τους ευαισθητοποιήσει σε θέματα βιώσιμης ανάπτυξης του θαλάσσιου περιβάλλοντος,
(ιιι) να λειτουργήσει ως εστία επιμόρφωσης των καθηγητών μέσης εκπαίδευσης, οι οποίοι προερχόμενοι από διαφορετικές επιστημονικές κατευθύνσεις έχουν επιφορτισθεί με τη διδασκαλία περιβαλλοντικών μαθημάτων, στις σύγχρονες γνώσεις λειτουργίας των θαλάσσιων οικοσυστημάτων και τάσεις απόψεων για τη βιώσιμη ανάπτυξη τους
(ιv) να αποτελέσει κέντρο δημιουργικού/επιμορφωτικού τουρισμού παρέχοντας στο ευρύ κοινό στον ελεύθερο χρόνο/διακοπές του γνώσεις και εμπειρίες για την ζωή στις θάλασσες   μέσω δραστηριοτήτων όπως καταδύσεις, αλιεία αλλά και συμμετοχής σε περιβαλλοντικές δράσεις και τέλος
(v) να αποτελέσει κέντρο επαγγελματικής κατάρτισης νέων επιστημόνων στις θαλάσσιες επιστήμες.
     Η θεματολογία, τα εκθέματα, η επιστημονική τεκμηρίωση, τα εκπαιδευτικά προγράμματα των μαθητών για το θαλάσσιο περιβάλλον και τα προγράμματα για τον επιμορφωτικό/δημιουργικό τουρισμό έχουν σχεδιασθεί και συνταχθεί από το Εργαστήριο Θαλάσσιας Γεωλογίας και Φυσικής Ωκεανογραφίας μέλος του Δικτύου Εργαστηρίων ΩΚΕΑΝΟΣ.