Το μουσείο βρίσκεται στο Ληξούρι, τη δεύτερη μεγαλύτερη πόλη της Κεφαλονιάς, στο νότιο άκρο της αποβάθρας. Είναι περίπου 500 μέτρα μακριά από το χώρο ελλιμενισμού του φέρι-μπότ της γραμμής Αργοστολίου-Ληξουρίου. Από πιο μακριά, ο διαδραστικός χάρτης της Google θα σας βοηθήσει να βρείτε το δρόμο σας προς το Ενυδρείο από οποιοδήποτε μέρος της Ευρώπης και του κόσμου.